要使用论文查重免费软件自动检测并标记重复内容，首先需要选择一款功能强大且准确率高的软件。其次，将待检测的论文文本输入软件中，启动自动检测功能。软件会分析文本中的内容，并标记出重复部分，同时给出相似度评分。在标记出的重复内容中，进行逐一查看，确认是否需要修改或引用。最后，根据软件给出的结果，进行论文修改，确保文本原创性和质量。

另外，在使用论文查重免费软件自动检测并标记重复内容时，也可以结合人工审查的方式，进一步提高查重的准确性。人工审查可以帮助发现软件可能漏检的部分，同时也可以对标记出的重复内容进行更加深入的分析和处理。综合利用软件自动检测和人工审查的方式，可以更好地完成论文查重工作，并确保论文的质量和原创性。